Alle deelkoren van het Muziekinstituut vormen samen het Kathedrale Koor en is ruim 100 personen groot. Het Kathedrale Koor zingt gemiddeld een keer per maand en met de grote feesten als Kerstmis, Pasen en Pinksteren. Ook bij belangrijke bisdomvieringen en grote concerten wordt dit koor in volle omvang ingezet.

Het repertoir van dit koor is breed en eeuwen van kerkmuziek zijn er in vertegenwoordigd. Vooral grote werken met orgel worden graag ten gehore gebracht, zoals missen van Vierne en Widor, werken van Andriessen en Strategier en uiteraard van Jan Valkestijn die Magister Cantus van het Muziekinstituut is geweest en veel werken voor het Kathedrale Koor heeft gecomponeerd.